EdGe | Edition des génomes

Anthony Gobert est responsable du plateau technique « Edition de génomes » (EdGe) de l’IBMP et se propose de vous orienter dans vos projets de production de mutants ciblés (KO ou autres).

Les systèmes crispR sont de plus en plus efficaces et en constante évolution. La cible des enzymes Cas est PAM (protospacer adjacent motif) dépendante (e.g. NGG pour SpCas9). Pour cliver des cibles partout dans le génome, une gamme d’enzymes Cas ayant différents PAM a été clonée dans un système de clonage-transformation maison (voir tableau).

Le plateau technique EdGe offre aussi des solutions pour le ciblage de plusieurs zones sur le génome ou des familles multigéniques avec des vecteurs pouvant contenir deux guides ou permettant le multiplexage de guides (voir tableau).

Le plateau technique EdGe dispose d’un couple de vecteurs pour le primeEditing, une solution d’édition du génome ultra-précise basée sur une séquence présente sur un guide ARN modifié (pegRNA) appelée ‘primer’ contenant la mutation voulue, un tag ou tout autre séquence. Ce système n’est pas basé sur la recombinaison homologue peu efficace chez les plantes mais sur la transcription inverse du ‘primer’ (voir tableau).

Veille technologique : le plateau technique EdGe cherche à acquérir les systèmes les plus performants du moment et à les introduire dans le vecteur de destination ‘maison’ pour une production de mutants toujours plus rapide.
Des protocoles sont à votre disposition ainsi que des conseils de plus en plus pointus grâce aux retours des utilisateurs du plateau technique.