PCR digitale (Stilla Technologies)

Instrument disponible sur la plateforme :

Naica (Stilla Technologies)

Vidéo de présentation par Sébastien Avizou (Senior Application Specialist) ici.

Le système Naica comprend :

• des puces Sapphire ou Opal
• la Géode (thermocycleur)
• le Prism 3 (scanner 3 couleurs)
• le Cristal Miner (logiciel d’analyse)

Puces Sapphire :

• jusqu’à 12 chambres par run (4/puce)
• 25000 à 30000 gouttelettes/chambre (volume de goutte de 0,59 nl)
• LOD 0,2 copies/µl
• Gamme dynamique = 5 log

Puces Opal :

• jusqu’à 48 chambres par run (16/puce)
• 20000 gouttelettes/chambre (volume de goutte de 0,22 nl)
• LOD 0,2 copies/µl
• gamme dynamique = 5 log

La détection se fait en PCR ou en RT-PCR avec de l’EvaGreen ou avec 3 couleurs en multiplex (TaqMan).

Instruments et puces

Vous trouverez ici les guides d’utilisation rapides (Quick User Guide) pour les puces Sapphire (QuickUserGuide_SapphireChips) ou Opal (QuickUserGuide_OpalChips).

Préparation des mix ADN et ARN

Vous trouverez les tableurs de préparation de mix ici :

Experiment_Planners_Naica_MIX_Sapphire (Stilla mix)

RNA_Sapphire_RT qPCR Taqman_assays_(qScript XLT One step RT-PCR mix)

DNA and RNA_Opal_PCR and RT PCR Taqman

Analyse

Logiciel d’analyse Cristal Miner à télécharger ici. Voir la procédure d’installation du logiciel ici.