Métabolomique
Missions et objectifs
La plateforme est spécialisée dans le développement de méthodologies basées sur des techniques de chromatographie et de spectrométrie de masse pour l’identification de petites molécules bioactives. Ces petites molécules sont nommées «métabolites» lorsqu’elles proviennent d’organismes vivants. La discipline scientifique qui consiste à identifier les métabolites se nomme la métabolomique. Ce terme métabolomique est apparu dans les années 1990.
Equipements
Chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse
Identification de métabolites volatils < 1000 Da (lipides, parfums : menthol, citronellol..). L’identification de petites molécules non volatiles est possible (sucres, acides aminés, acides organiques, nucléotides..) si elles sont rendues volatiles, par une technique de dérivation chimique (alkylation des fonctions polaires). Quelques centaines de métabolites peuvent être identifiés à partir de 1μl d’extrait brut de plante par ex. L’identification des molécules se fait par interrogation de bases de données publiques et internes au laboratoire
Chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse basse résolution
Instruments les plus sensibles pour l’identification et la quantification fine de métabolites < 3000 Da, seuil de détection < fmol. Analyses ciblées uniquement (je sais ce que je cherche) sur la base d’injection au préalable de molécules de référence (standards). On peut ainsi identifier et quantifier quelques centaines de métabolites, même faiblement abondants, dans un extrait brut de plante en une seule analyse. Identification et dosage des métabolites présents à l’état de traces dans l’environnement (micropolluants), tels que les pesticides, les médicaments présents dans les eaux usées, le sol et les plantes qui dépolluent.
Vous trouverez ci-dessous les documents nécessaires à l’ouverture de projets et à l’analyse d’échantillons.
Fiche descriptive des échantillons basse résolution_V5
Fiche descriptive des échantillons QTOF_V4