Analyse de l’expression génique

La plateforme d’analyse d’expression génique (AEG) a pour objectif d’offrir, aux équipes de recherche publiques et privées, des outils et compétences pour la réalisation de leurs projets de recherche portant sur la génomique, la transcriptomique et l’épigénétique.

La plateforme dispose d’instruments pour la réalisation des projets de séquençage (Oxford Nanopore, NGS-Illumina et Sanger), de génotypage (HRM) , d’analyse d’expression génique (qPCR) et de PCR digitale ( ddPCR).

Conditions d’accès à la plateforme

L’accès aux instruments et aux services de la plateforme sont régis par la charte d’utilisation des plateformes et des plateaux techniques de l’IBMP.

Vous devez en prendre connaissance et la signer avant tout accès à la plateforme.

Moyens et équipements

  • Séquençage Oxford Nanopore : PromethION P2 et 2 MinION avec adaptateur Flongle
  • Séquençage NGS Illumina : MiSeqPCR digitale: Stilla Naica System
  • Analyse d’expression génique par qPCR et génotypage HRM : LC480 (Roche) 384 puits
  • Contrôle qualité des échantillons et librairies de séquençage NGS : Bioanalyser 2100 (Agilent) ; Qubit (ThermoFisher Scientific)

Contacter la plateforme?

Pour soumettre un projet à la plateforme AEG, bénéficier d’une formation ou d’un accompagnement dans la réalisation de vos analyses, contactez-nous par courriel

Expertises

Séquençage d’ADN Sanger (AppliedBiosystems)

Séquençage de plasmides complets

Séquençage NGS lectures courtes (Illumina)

Séquençage NGS lectures longues (Oxford Nanopore)

PCR quantitative en temps réel (Roche)

Génotypage à haut débit par HRM (Roche)

PCR digitale/numérique (Stilla)

Contrôle qualité de l’ARN et de l’ADN

Purification d’ADN avec les billes magnétiques


Reconnaissance et valorisation

La plateforme doit obligatoirement être citée dans les remerciements des publications. Si le degré d’implication dans les travaux le justifie, les personnels de la plateforme doivent être inclus dans les auteurs des publications. Une copie des articles sera envoyée au responsable de la plateforme après publication.